Saat ini tahun 0079 dalam Era Universal. Umat manusia telah berpindah ke luar angkasa, tinggal di gugusan koloni yang dikenal sebagai “Sides.” Salah satu Sides tersebut memproklamirkan diri sebagai “Kerajaan Zeon” dan menyatakan perang terhadap Federasi Bumi, badan pemerintahan yang saat ini menguasai Bumi. Dengan menggunakan robot humanoid yang sangat kuat yang dikenal sebagai “mobile suit,” Zeon dengan cepat menguasai situasi.

Sembilan bulan setelah konflik dimulai, Federasi Bumi telah mengembangkan mobile suit kuat miliknya sendiri yang disebut Gundam. Ketika Zeon melancarkan serangan terhadap koloni yang menampung Gundam, seorang warga sipil berusia 15 tahun bernama Amuro Ray tiba-tiba terjebak dalam konflik yang akan membawanya berkeliling Bumi dan angkasa, mempertemukannya dengan pilot andalan musuh, Char Aznable.